台灣爆發首例高病原性禽流感，各界對農委會的處理方式有不少疑慮。農委會防檢局副局長黃國青今(5)日下午召開記者會表示，一切依既定程序處理，如流程有問題，將會進行檢討改進。
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外界認為農委會對於禽流感疫情處理過慢，黃國青澄清指出，農委會家畜衛生試驗所的禽流感檢驗有一套流程，通常需花費一個月的時間。因此即使經實驗室檢驗出高病原性的H5N2病毒後，仍需由專家會議來判定，如果專家快速確定，農委會即可馬上通報。針對在場記者質疑農委會將處理緩慢的原因推給與會專家，黃國青強調，一切尊重專家的決定。
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根據世界動物衛生組織(OIE)認定高低病原性的根據在於病毒對禽鳥的致病指數(IVPI)大於1.2，及介於H、N抗原之間的鹼性胺基酸，若超過1即屬於高病原性。包括導演李惠仁及多位專家質疑農委會以雞隻死亡率判斷高低病原性有問題，但黃國青提出，民國92年10月制定國內的高病原性檢驗方法，除了實驗數據外，臨床症狀也在判定範圍中，因此彰化芳苑鄉的雞場狀況平穩且死亡率低，才會在1月以低病原性禽流感向OIE通報。後來因台南案例為高死亡率，因此經過專家綜合兩案的情況判定為高病原性，於3月3日時向OIE通報台灣為高病原性案例，並去信OIE表示要更改1月份的通報結果。
除了彰化芳苑鄉及台南六甲區的案例，目前彰化縣及南投縣再爆發出2例感染H5N2的案例。黃國青表示，日前經由台中肉品市場發現彰化一處蛋雞場感染禽流感，內部有9000隻土雞；而農委會主動監測後也發現南投一間有45000隻蛋雞的養雞場也測出感染情況。目前兩件案例仍由實驗室檢驗中，尚未判斷是否為高病原性病毒。現場也已實施移動管理，進行緊密監控。
