國光石化在彰化設廠的爭議越演越大，包含生物多樣性、公共衛生、大氣、水資源及農業等領域的280多位專家學者提出6大反對意見，反對國光石化在台設廠。
學者質疑石化業是高污染產業，未來彰化設廠的懸浮微粒（PM2.5）、二氧化硫、臭氧等生產廢棄物將嚴重影響全台從南到北的空氣，國光石化雖在中部設廠，卻是南北遭殃。
中興大學應用經濟系教授陳吉仲表示，自6月下旬開始的連署活動，目前已累計了280多位的教授參加，預計在7月中環保署的環評大會前，眾專家學者分成5大專業領域，向社會大眾陳述反對國光石化的開發意見。
雲林六輕設廠10年，學者指出排放的二氧化硫、有機碳化合物、懸浮微粒及戴奧辛等，經環境工程模型及全台癌症死亡人數模擬結果，國光石化營運會造成全台民眾遭受呼吸道、心血管疾病之苦，健康代價太高。
政府一直高喊節能減碳的口號，學者也說台塑六輕1年就排放6,700萬公噸二氧化碳，國光石化預估營運會增加全台每年1,200萬公噸，2008年全台二氧化碳排放量已2.5億公噸，這2廠排放就佔全台排放量3分之1，卻要民眾承受減讓代價。
彰化、雲林地區皆是供應全台農漁產品的大宗，學者憂心指出2地將遭受重大污染；此外國光石化將引用彰化北部的水資源到南彰化，六輕已使得雲林水資源匱乏，國光石化的用水問題，勢必加速惡化中部的水資源使用狀況，讓農民繼續抽取地下水。
另外，彰化4,000公頃的豐富生物，與瀕臨絕種的中華白海豚都會因為國光石化開發，遭受破壞與絕種。
