馬英九已不願聽蕭旭岑解釋。
政治圈傳聞蕭旭岑在某些兩岸事務或對外發言上，被質疑未經馬英九授權卻對外宣稱為馬的意旨。蕭旭岑本人則在廣播節目中透露，事件爆發後他曾求見馬英九遭拒，顯見兩人的互信已完全破裂。
此事件為國民黨內部的「宮廷鬥爭」縮影，不僅涉及法律的「公益侵占」嫌疑，更顯示出馬英九與其長期心腹幕僚蕭旭岑之間的信任崩解。
這場由馬英九基金會掀起的人事風暴，核心前總統馬英九與其長期幕僚、前執行長蕭旭岑之間已公開決裂。此事件為職場上的「權力逾越」、「假傳聖旨」，更上升到法律調查與政治路線的切割。「權力逾越」、「假傳聖旨」是職場工作倫理極大禁忌，指員工利用與高層的私交或特殊管道，扭曲事實或傳遞假消息，未遵守公開透明工作倫理。藉此操弄組織非正式權力。這種行為會建立錯誤的工作標準、破壞信任、架空主管權限，對團隊士氣造成嚴重破壞。
在台灣政治與幕僚工作中，「權力逾越」、「假傳聖旨」被視為嚴重的倫理禁忌與職務操作大忌。這類行為指幕僚、助理或代理人假借高層名義，擅自發號施令、決策或承諾，嚴重損害指揮系統與信任基礎，通常會導致立即性的職務解僱或政治信用破產。
政治工作核心在於「授權（Authorization）」。未經長官同意，私下以長官名義向行政部門、公眾或媒體承諾事項，不僅是越權，更是欺騙。政治體系重視層級，假傳聖旨會導致「上有政策，下有對策」的混亂，長官無法掌控核心業務與對外溝通。當假傳的消息曝光，會讓公眾認為該政治人物管理鬆散、表裡不一，嚴重影響支持率。馬英九在專訪中已明確點名，蕭旭岑與前執行長王光慈的去職主因是涉嫌違反財政紀律。而馬辦指出，兩人在職期間常赴中國大陸接觸台商，中間疑似存在財務問題，目前基金會董事會已成立專案小組進行調查，並揚言若有不法將送司法處理。
馬英九的政治風格正是「不沾鍋」。
馬英九基金會發表已正式聲明，強調蕭旭岑未來的任何言論與行為都不代表馬英九，此舉被視為一種極端且徹底的政治切割。此舉被媒體形容為馬辦內部的「宮廷內鬥」，不僅削弱了蕭旭岑過去作為馬系大將的政治分量，也讓外界關注這是否代表馬英九試圖清除身邊特定的兩岸代理人色彩。
雖然這場藍營宮廷內鬥風暴，目前仍處於「各說各話」與「調查中」的階段，但可以肯定的是，蕭旭岑已正式淡出馬英九的核心圈，在台灣政治幕僚文化中，一句「這是老闆（或長官）交代的」，若非真話，就是斷送政治職涯的炸彈。一言以蔽之，蕭曾所擁有的「馬意代表」光環已迅速消失。
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