中研院副院長周美吟今天(4日)凌晨在臉書以「何時我們的大學校長『遴選』能夠跳出台灣的『選舉』文化？」為題發文，舉美國哈佛大學和加州大學柏克萊分校校長遴選為例，期盼未來大學校長遴選「不會再被有既定立場的人士捕風捉影、不斷抹黑，讓高等學府的校長『遴選』遠離台灣的政治與選舉文化。」
周美吟指「看了美國哈佛大學和加州大學柏克萊分校校長遴選過程的報導，了解原來校長遴選是有可能這麼周延、如此有理性的」， 感嘆台大校長遴選這一年來的紛爭，「校長遴選原是校內之事，照理說應是全校教師、學生、職員共同關切參與的。遴選的目的是要選擇出一位領導者與掌舵人，但最後卻演化成為政治事件。」
周美吟說：「大學校長遴選程序的重心在遴選委員會，理應負責廣泛徵求合適人選，進行過濾篩選，用面談及其他方式深入了解候選人，並經過充分討論後做成共同決定。」並認為「所有關心台灣高等教育的人，都會贊成教育部重新檢討大學校長遴選的實際面向，讓遴選委員們能夠保持高度、公平運作，避免發生有如地方選舉般的操作、配票、拉票等違反遴選精神的作為。」
周美吟最後期盼：「希望日後有理想有勇氣投身大學校長遴選的候選人，不會再被有既定立場的人士捕風捉影、不斷抹黑，讓高等學府的校長『遴選』遠離台灣的政治與選舉文化。」
周美吟是2017年台大校長遴選時唯一一位女性校長候選人；台大校務會議推薦投票，與陳弱水、陳銘憲、張慶瑞與管中閔等四人一同進入第二階段投票。2017年12月1日《新頭殼》報導，周美吟在台大校長遴選說明會中，被台大心理系教授黃光國提問：「有遴選委員是你的直屬長官(意指：擔任遴選委員的中研院院長廖俊智)，有沒有構成利益迴避問題？」周美吟表示，這是一個事實，在接受台大教師推薦時，她有想過這個問題，當初也看過遴選辦法準則，「在遴選期間，不得與遴選委員有私人接觸，我和我的上司絕對有遵守這樣的規則，我們是個體，是私人身份參與。」周美吟說：「這不是我適合回答的，是遴選委員要來回答的，我照著規則來作。」強調「公私分明」！
