中秋教師節連假期間，高鐵傳出自由座旅客外溢至商務車廂的爭議。高鐵公司指出，為了在明年7月新車上線前，突破現行34組列車的運用限制，進一步提升超尖峰時段運能，自8日國慶疏運首日起，每週五17時至21時將加開南港、台北往台中的南下列車，每小時2班、4小時共8班，並採全車自由座方式提供服務，預估可縮短旅客等候時間約1小時。

日前傳出，高鐵在中秋教師節連假疏運期間，出現旅客上不了車、自由座旅客外溢至對號車廂，甚至進入商務車廂等情況。為了解決旅客反映的問題，高鐵公司因此提出「週五下班超尖峰時段」特殊調度疏運辦法。由於每週五下班時段(17時起至21時以前)，通勤與返鄉兩種旅客同時湧現，本就是高鐵旅運尖峰，若再遇重要連續假期，自由座旅客人數更會瞬間暴增。

高鐵進一步分析，自由座最擁擠的路段為台中以北，爆量的自由座排隊人潮造成車站擁擠，進而影響對號座旅客上下車動線，導致整體疏運品質下降。因此，除了增加南下列車外，疏運期間也將採更彈性的列車調度方式，並將部分列車自由座擴大至9節或11節，以提供更充裕的自由座運能。

而這項「特別調度」的原理，是將列車進入基地折返的程序改在月台快速折返，讓列車僅需12分鐘即可再度發車，藉此搶下約1小時的寶貴時間，並減少北上自由座旅客的等候時間。同時，疏運期間總計提供23班列車，將自由座擴大至9節或11節，以加強疏運旅客。

此外，為鼓勵旅客利用離峰時段分流搭乘，台灣高鐵也將在8日加開深夜延後收班車次，以及10日加開北上列車各1班，達成均化旅客、分流搭乘的疏運目標。