中國演習不只可能影響台灣航道，氣象雷達也可能受到軍事干擾。氣象署指出，雷達收到的訊號並非全部來自天氣，也可能出現地形、海面及其他異常干擾，其中新北五分山氣象雷達，前年及去年都曾在中共演習期間，受到較強的「軍事干擾」。這類異常訊號看起來像放煙火，必須經過辨識並排除，否則可能影響降雨估計。
中央氣象署科技發展組降水技術科技正唐玉霜，今日在氣象實務研習班表示，雷達除了偵測天氣外，也可能受到地形雜訊、海面雜波及其他異常干擾回波影響。每種情況的呈現方式不同，有的呈現扇形、圓圈或放射狀，「一看就不是天氣的系統」。
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甚至前年及去年，在中共演習期間，五分山氣象雷達還受到「對岸軍事干擾」。這類軍事干擾出現時，有時原本天氣很好，雷達畫面卻突然冒出大片放射狀訊號。氣象署專業人員可以從訊號特徵辨識異常，但若沒有及時清除，後續產品就可能跟著出問題。
例如，雷達資料會進一步用於定量降雨估計，也會提供水利署作為都市防洪參考；若原本沒有降雨，資料卻因異常訊號突然出現很大的數值，就必須進行雷達資料品管，趕快將異常訊號排除。雷達資料品管就是針對原始觀測資料進行處理、篩選及修正，核心工作包括去除地形回波、昆蟲、雜訊等非氣象目標，以提升資料的準確性及可靠性。
不過，目前氣象署研發團隊持續改善雷達資料品質，因此去年已有新技術上線，可以更快速辨識並排除這類異常訊號。而大家平常看到的台灣整合雷達圖，是由多部雷達資料組合而成，可即時掌握台灣附近天氣系統的位置及強度變化，進一步估計降雨，提供未來0至3小時的即時預報，對快速變化的強對流天氣尤其重要。