花蓮光復地區有140多公頃農地，因堰塞湖溢流、淤土堆積太深無法復耕。對此，行政院表示，這批無法復耕的土地，政府原規劃辦理「價購」，過程中卻發現許多土地所有權人持有土地長達5、60年從未交易，因此若採私法買賣過戶，100多公頃土地將被課徵高達上億元的土地增值稅。因此，行政院正式宣布改採「政府徵收」方式取得土地。如此一來，農民便能依法免除土地增值稅的負擔。
而針對部分農民提出「以地易地」延續耕作的需求，行政院則表示，在土地查估過程中，將同步調查農民的耕作意願。後續將由農業部盤點出適合耕作的國有或台糖土地，改以「承租」方式提供給農民。因為若直接進行土地所有權調換，往往會因土地價值估算繁複、後續抽籤分配等行政程序，導致復耕時程嚴重延誤；改採政府盤點土地出租，不僅操作簡便，更能讓農民在最短時間內重新投入耕作。
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花蓮光復地區因馬太鞍溪堰塞湖溢流，導致沿岸高達773.9公頃的農地嚴重受損，淤土層嚴重淤積深達4至5公尺，其中最高甚至達8公尺。面對水路中斷、淤土缺乏地力，以及形成不透水「果凍土」等多重困境，農業部花蓮農改場已依據淤泥堆積深度，將災區劃分為輕度、中度與重度，並因地制宜採取清疏水路、翻耕改良及系統性客土等不同的重建方案，全力協助農友復耕。
