立法院14日針對國民黨與民眾黨提出的公投案進行表決，最終包含鞭刑、重啟核電以及交通罰鍰專款專用等3案，在藍白兩黨的人數優勢下順利通過。然而，在此次表決中，藍白陣營也出現明顯的意見分歧。民眾黨團於表決當日上午宣布，對國民黨提出的鞭刑公投全體投下棄權票；而國民黨也未支持民眾黨所提出的安樂死公投，最終該案僅獲得7票贊成、51票反對而遭到否決。至於民眾黨力推的移轉投票公投，則未被排入此次議程。
面對外界質疑藍白合作是否生變，民眾黨前主席柯文哲 15 日前往台中輔選受訪時給出明確答覆。柯文哲表示，展望 2026 年地方選舉，藍白合依然是一個不可阻擋的趨勢。針對國民黨未支持民眾黨提議的安樂死公投一事，他坦言這非常正常，兩個政黨本來就不可能在每件事情上都保持意見完全一致。
柯文哲進一步強調，藍白合的核心概念是「合作不是合併」，兩個政黨各自保有獨立的自主性與主體性，面對不同的社會議題，自然會有各自的堅持與立場。他更特別引用美國前國務卿布林肯（Antony Blinken）過去的政治態度來定調未來的雙方關係，指出政黨之間應該是「可以合作的時候合作，需要競爭的時候競爭，必須對抗的時候對抗」。
柯文哲呼籲，政治運作不應該在明明可以合作的時候卻刻意選擇對抗，這樣的做法並不正確，也明確點出未來藍白在競合關係上的戰略主軸。
