2021年疫情期間慈濟基金會採購BNT新冠疫苗遭詐騙10.6億元，當時競選台北市長的立委蔣萬安，以及國民黨政治人物都曾嗆，要相信慈濟還是相信民進黨。對此，時任衛福部長、現任行政院政委陳時中今（7）日表示，當初做出不實指控的人，應該對社會有所道歉。他也說，應該譴責詐騙者，而慈濟是受害者，後續司法會調查清楚。
民進黨發言人李坤城說，這是藍白大型翻車現場，回想那段採購疫苗過程，陳時中不斷提醒當時有許多「疫苗掮客」，若沒有正式獲得廠商授權，都很有可能受騙。然而卻引來當時的台北市長柯文哲、立委蔣萬安、江啟臣、柯志恩、鄭麗文、台北市議員徐巧芯、羅智強及等政治人物，無端抹黑與詆毀，聲稱民進黨政府與防疫團隊在阻撓民間自行採購疫苗。
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陳時中今上午出席「第三屆高齡健康產業博覽會」，並於會前接受媒體聯訪表示，防疫是一個國家社會重大的事情，當初在選舉的時候，大家為了選舉的利益，對於執政團隊或防疫團隊極盡抹黑，現在真相已經大白。他相信當初做出不實指控的人，應該對社會有所道歉。
媒體詢問，博覽會裡面有慈濟的單位，是否會過去看看？陳時中回應，「看他們怎麼安排。」不過他說，要譴責的是詐騙者，而慈濟是受害者，對於抹黑相關不實的指控要予以譴責，而慈濟是受害者，司法大概會調查得更清楚。
陳時中說，當時社會都相當恐慌，對於疫苗需求孔急，所以詐騙往往在大家心理最脆弱的時候就會侵入。他提醒大家，在困難的時候特別要注意這些詐騙的行為。他說，當初很多國際規則、疫苗使用等，在個人或是單獨的團體很難跟總公司取得疫苗。
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陳時中表示，他當時不斷提醒，只要說先拿出訂金，而拿不出出貨證明等，都有可能是詐騙。他說，政府也收到很多相關的詐騙行為，政府都一一地拒絕澄清，但後來的選舉造成很多曲解跟污蔑，他還是覺得非常遺憾。
至於慈濟後續購買疫苗的狀況，陳時中則說，他不清楚，但當時購買疫苗一定要回歸正規管道，讓政府協助大家取得疫苗，取得台灣最大的權益。
