馬英九基金會人事風波爆發後，《鏡週刊》昨引述不具名人士說法指，北京早在今年3月下旬就接獲訊息，認為基金會風波恐擴大為國民黨內部路線衝突，曾要求涉台系統「務必保蕭」，避免事件衝擊後續兩岸交流。對此，馬英九基金會前執行長蕭旭岑今（3日）指責週刊報導內容造謠，甚至認為「疑似是馬辦提供的訊息」。

蕭旭岑中午接受資深媒體人黃光芹專訪。他表示，這個案子已經進入司法程序，他高度尊重司法，會完全配合士林地檢署的偵查動作，所以，他基於尊重司法，不希望再對外針對案情發言。

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蕭旭岑接著說，很遺憾，昨天《鏡週刊》還是有用爆料的方式，用疑似是馬辦提供的訊息去做一些不實陳述，他昨天為此發出聲明。如今已進入司法偵查階段，呼籲有心人士不要再對外放話。

蕭旭岑再表示，他也很遺憾，有一些政治性的造謠，說什麼北京介入要「保蕭」，還說是國民黨路線之爭。這些完全不是事實，他必須鄭重澄清，馬英九基金會的風波本身跟北京沒有任何關係；而且，之前有些不實報導，說前總統馬英九因為去年在敦煌講了「和平民主統一」，結果就不能再去中國，針對這部分，中國已經公開否認。

蕭旭岑重申，他希望不要再去做這些政治性的攻擊，這個案子本身已經進入司法，就尊重司法，藉由司法來釐清；而不是藉由放話、藉由媒體意圖去製造錯誤印象或攻擊兩岸關係。

至於國民立委謝龍介建議，捲入風波的蕭旭岑應向國民黨主席鄭麗文請假、停職。蕭旭岑回應，他已經公開說過，如果他有涉及不法，他願意辭去國民黨副主席。