政府大力挹注的聯合再生爭議不斷。監院針對崇太能源公司陳情調查發現，聯合再生前公司新日光，於105年投資墨西哥太陽能電廠，雖已於107年完工，但因墨西哥政府能源政策轉變，雖然聯合再生子公司提起訴訟勝訴，但快8年了，該電廠目前還沒進入商業運轉。
聯合再生原為新日光能源科技為擴大聯盟，於民國106年以換股方式與昱晶能源科技、昇陽光電科技合併，由新日光公司為存續公司，並以私募特別股方式辦理現金增資45億元，由國發基金產業創新轉型基金投資22億元，經濟部所管耀華玻璃股份有限公司投資23億元。並於107年10月1日完成合併，更名為聯合再生能源股份有限公司。隨後函請國發基金繳納投資股款，該基金則於107年10月12日撥付投資股款13億9,065萬餘元。
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本案源自崇太能源公司向監察院陳情稱，永旺公司與其合作，雙方簽署墨西哥電廠開發合約，約定永旺公司應支付808萬5,000美元開發費予崇太公司；惟其後永旺公司不但以各種理由要求減價，於107年4月專案完工後，又以專案未連線為由，遲未支付尾款99萬8,497.5美元予崇太公司。崇太公司向國發會陳情，仍未獲妥適處理。監委賴振昌也就此提出調查。
調查報告指出，聯合再生公司子公司於105年計畫在墨西哥Hermosillo開發太陽能電廠專案，但因不熟悉當地開發與交易慣例，所以委由US Topco（崇太能源公司美國公司）協助與當地開發商洽談交易並簽署股份買賣協議，並簽署服務合約。
調查指出，該電廠雖已於107年4月「機械完工」，完成主要工程項目與所有設施建置，具備啟動測試及申請併網條件，然因墨西哥能源政策變動、新冠肺炎疫情導致行政審查延宕，多次向主管機關申請展延商轉日，但卻遭拒，聯合再生子公司提出訴訟，雖然一、二審都勝訴，但尚待待墨西哥國家能源委員會履行判決所定義務後，方能啟動後續行政程序。
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對US Topco要求交付尾款99萬8,497.5美元，聯合再生子公司認為，該顧問費尾款之付款條件為電廠完成商轉後15個工作天內支付，與107年之機械完工無直接關聯，而商轉日係以墨西哥主管機關完成行政程序並正式通知為判斷依據，迄今仍未完成，故付款條件尚未成就，自無違約延遲付款。
監委審酌後認為，本履約爭議案屬民間商業行為及私契約爭議，如當事人雙方有未依合約履行責任或義務之情事，允宜循司法途徑解決。
