針對南非外交部於2025年1月再度致函，要求我國駐南非代表處於3月底前完成搬遷，外交部長林佳龍第一時間召開緊急應變會議，並指示我國駐南非代表處秉持對等與尊嚴原則，持續與南非外交部（DIRCO）交涉。外交部今（16）日表示，雙方目前正就修改雙邊關係法律架構的可能內容交換意見，我方已促請南非盡快就正式談判的地點、時間、代表團組成及協議簽署方式等細節展開討論。

外交部指出，南非外交部在雙方協商尚未達成共識前，片面於其官方網站更改我國駐處名稱，並再度違反1997年台南雙邊協議，令人遺憾。對此，林佳龍部長已即刻指示亞非司及我國駐南非代表處，分別向南非聯絡辦事處及DIRCO提出嚴正抗議。我國駐南非代表處亦已另行致函南非政府，正式表達我方立場，強調南非援引聯大第2758號決議及「一中政策」逼迫我駐處搬遷，不僅缺乏合理依據、邏輯矛盾，更令人無法接受。外交部重申，南非配合中國打壓台灣的做法，違背其一貫主張的民主自由精神，並要求南非政府尊重1997年雙邊協議。

外交部進一步表示，南非近期屢次違反國際規範，已引發國際社會關注。例如，南非駐美大使拉蘇爾（Ebrahim Rasool）近日因相關言論不被美國接受，已於本月15日被美國國務卿盧比歐（Marco Rubio）列為「不受歡迎人物」，顯示南非外交立場正受到國際質疑。

外交部最後嚴正呼籲南非政府，在雙方達成共識前，不應採取任何違反1997年協議的單邊行動，並應盡速與我方積極討論相關細節。外交部將持續密切關注本案發展，堅定捍衛國家尊嚴與權益。