前台北市長柯文哲涉貪被羈押禁見及起訴後辭去民眾黨主席，新任民眾黨主席黃國昌接受日本媒體《日本經濟新聞》專訪，提到許多對於政治時事的觀點。其中，關於中國當局所堅持的「九二共識」，黃國昌直指「它並不存在」，被問到為什麼過去強烈反國民黨如今卻與他們合作時則解釋，這是為了「監督執政黨」、「推動兩黨有共識的法案」。
黃國昌受訪時針對兩岸議題指稱，國民黨希望和中國有更緊密的關係；民進黨則是口頭捍衛台灣主權，但台灣民眾黨不一樣，對中國議題「沒有太多的意識形態」，九二共識並不存在。民眾黨捍衛台灣主權，這百分之百是民眾黨最重要的價值，但這不代表民眾黨不能和中國進行善意對話及溝通。
此外，黃國昌在2016年10月31日的一場演講中「跟大家講一句話，不要懷疑我要消滅中國國民黨的決心。」也曾譏諷「我最看不起的就是中國國民黨」，多次公開傳達強烈反藍立場。《日本經濟新聞》犀利提問，過去曾經強烈地反對國民黨的他為什麼現在與國民黨組聯盟？如何說明中間矛盾？
黃國昌聲稱：「第一，作為在野黨，監督執政黨；第二，推動兩黨有共識的法案」，他宣稱：「當我們推動改革法案時，讓人感到驚訝的是，過去反對改革的國民黨，願意與民眾黨合作，但民進黨卻不願意」。然而，如今國民黨仍對不當黨產一事堅持「反對改革」，包括黃國昌在內的民眾黨8席立委集體先前卻缺席不當黨產凍結案的表決，引起批評聲浪。
查看黃國昌的臉書貼文，2016年時他發文痛批：「做這麼無恥的事，還嘻嘻哈哈，經過今天，我確信，恥度無下限的中國國民黨，沒有悔改可能。」黃國昌更直言：「該做的事，就是徹底消滅它，躲了今天，躲不了下週。臨時會第一案：通過《不當黨產處理條例》」。
黃國昌當年也在臉書發文指出：「追討國民黨不當黨產的課題，是台灣民主轉型的關鍵試煉。」他並強調：「不當黨產的問題，從來就不只是國民黨本身而已，過去因黨國不分的產生的各種附隨組織，如婦聯會、救國團等，透過不公議手段所取得的財產，也應一併清查歸還。」
國民黨、民眾黨去年強推國會擴權法案，引發數萬人上街抗議。黃國昌為了讓該法案三讀通過，不但選擇與國民黨合作，還被昔日他痛批「權貴犯罪果然不一樣」的國民黨團總召傅崐萁當眾「摸頭」，不惜以破壞程序正義為由，以人數優勢讓相關法案三讀通過，之後又與國民黨聯手提案刪除、凍結多筆預算，不少民眾對黃國昌與國民黨熱切合作感到憤怒。
傅崐萁對黃國昌進行摸頭殺。 圖：翻攝卓冠廷臉書
