截至12月30日，國內流感疫情進入流行期，第52週類流感門急診人次達10萬9千，超過流行閾值，A型H1N1為主要病毒，累計重症369例、死亡85例，9成未接種疫苗。疾管署宣布，自114年1月1日起，擴大公費流感疫苗接種至滿6個月以上未接種者，並開放新冠Novavax JN.1疫苗，為不適合接種mRNA疫苗者提供選擇。歲末聚會及春節增加傳播風險，疾管署籲民眾儘速接種疫苗保障健康。
疾管署表示，目前流感疫情，A型H1N1仍為目前主要流行病毒，上週新增19例流感併發重症病例，自10月起累計369例，其中死亡病例累計85例，9成以上未接種疫苗。國際間流感活動也呈現升溫，日本於12月疫情驟升，達往年高峰水準，越南、柬埔寨等國家病例數亦明顯增加。
新冠疫情部分，12月24日至12月30日新增10例本土重症病例，累計本季重症421例、死亡95例，其中98%以上未接種Moderna JN.1疫苗。全球新冠陽性率持續攀升，變異株以KP.3.1.1及XEC為主，XEC占比快速增加。鄰近國家如日本病例數上升趨勢顯著，疫情威脅不容小覷。
疾管署統計，截至12月30日，公費流感疫苗接種577.7萬人次，使用率約87.7%，低於去年同期。流感疫苗接種率以65歲以上長者及學齡前幼兒居多，分別為44.4%與63.7%，仍未達目標。新冠疫苗接種人數已達177.3萬人次，為去年同期的2.3倍，顯示民眾對新冠疫苗的接種需求有所提升。
自1月1日起，未接種流感疫苗的6個月以上民眾及具中華民國國籍或居留證的外籍人士均可施打公費流感疫苗，直至疫苗用罄為止。新冠疫苗方面，Novavax JN.1疫苗將提供對mRNA疫苗不適者接種，避免重症與死亡。疾管署提醒，已接種Moderna JN.1疫苗者無需重複接種Novavax JN.1。
歲末活動頻繁，疾管署呼籲民眾，特別是65歲以上長者、幼兒及慢性病患者，應儘速完成流感及新冠疫苗接種，以降低感染後重症及死亡風險。民眾可先透過各地方政府衛生局網頁、疾管署流感防治一網通、疾管家或1922防疫諮詢專線，查詢鄰近合約院所，再電洽院所詢問預約，以確保可施打到疫苗且節省排隊等候時間。
