衛福部長邱泰源21日出席台灣醫務管理學會年會時爆料，賴清德總統曾因醫療院所減碳議題致電罵環境部長彭啓明，行政院回應，部會針對政策溝通是常有的事情，邱泰源談話是強調內閣團隊的施政效率及求好心切，應用正面態度去觀察。彭啓明則表示，環境部正「彎道超車」減碳，賴清德關心議題而有相關討論，不認為賴清德對他有所責難。

邱泰源21日出席台灣醫務管理學會「第9屆第3次會員大會暨2024年THIS學術年會」致詞時透露，衛福部正向環境部爭取日後碳費能部分撥入醫療領域，賴清德曾認為環境部沒給足夠資源，為了醫院推淨零減碳一事「總統打電話罵彭啟明」，質問「把這件事情弄得這麼大條，有沒有讓醫療院所有錢做這件事？」

對此，國民黨立委王鴻薇批評這顯示內閣不團結，以及賴清德作法不符體制。不過，邱泰源澄清，自己與彭啟明是好朋友，無溝通不良，並將持續助醫療院所節能；彭啓明受訪時也說，環境部正「彎道超車」減碳，賴清德關心議題而有相關討論，彭啓明表明：「我不認為有責難」。

行政院人士指出，跨部會針對彼此相關政策溝通、對話，是常有的事，這些交流與調整的互動過程，也是AI行動內閣積極任事、快速溝通的施政特色。邱泰源談話是強調內閣團隊的施政效率以及求好心切，因此應該用正面的態度去觀察，而不是用負面批評的角度去看待，且既無關所謂的負面批評，當然也沒有炒作的意義。

至於推動醫療院所減碳部分，行政院人士提到，推動醫療院所及各產業營業場所的減碳，例如節能措施或淨零建築等，都是政府淨零轉型重要工作項目，行政院也有跨部會的協調機制，環境部已和經濟部、金管會展開合作，導入保險基金資金幫助醫療院所進行深度節能。