民眾黨主席柯文哲的妻子、台北市立聯合醫院醫師陳佩琪透過臉書宣布，確定9月底會提早退休，離開原因並非人生規畫，只是醫療專業和行政能力已不符台北市衛生局要求，她感嘆：「我已經努力做到衛生局的期待了，現在做不下去只好自己滾蛋」。對此，台北市立聯合醫院表示，陳佩琪申請提早退休涉及醫師個人的生涯規劃，尊重其生涯規劃。

現任台北市立聯合醫院和平婦幼院區中正門診部主任的陳佩琪7日在臉書發文寫道，將在9月底提早退休，已著手辦理相關手續，從前人家問她什麼時候退休，她都說「還早呢」，如今決定提早離開，不是什麼人生規劃，只是個人的醫療專業和行政能力現在已經不符合台北市衛生局要求。

陳佩琪提到，她在聯醫服務36年，現職院外門診部的編制就只有她一人，護理師是支援的，沒有藥局或醫檢部門，卻得做成人健檢、口腔癌篩檢和失智症評估等，還會被要求業績。衛生局想在院外門診部執行這些業務不是不行，但理應派人支援，而不是要她一人想辦法。她已經做不下去了，但還有許多基層醫護人員仍在掙扎，希望官員給他們「一絲絲的尊重」。

台北市立聯合醫院當天晚間發布新聞稿回應，對於陳佩琪申請提早退休，涉及醫師個人的生涯規劃，尊重其個人規劃。12區院外門診部以各行政區特色作為發展規劃，建構分級醫療社區整合照護，並配合政府推動各項公共衛生業務，包含延長服務時間、執行老人健檢及各項預防保健篩檢等，以達「一家就診、聯合服務」的理念。