前總統陳水扁犯下龍潭購地等重大弊案遭判刑20年，而他入獄6年多後以罹患失智等疾病為由，2015年獲准保外就醫，但他9年來卻到處趴趴走，還出庭幫女兒陳幸妤打官司，頻踩保外就醫紅線，遭輿論抨擊重創司法尊嚴、激化社會對立，藍綠陣營也持續針對特赦陳水扁相關議題展開政治攻防。然而，鏡週刊報導揭露，蔡英文總統「為了解決相關爭議」，已經決定要在520卸任前特赦陳水扁，並由幕僚單位啟動特赦作業，研議相關配套措施。

鏡週刊報導提到，知情人士透露，幕僚研議，針對已判陳水扁有罪確定的龍潭等4大弊案，由蔡英文根據憲法第40條賦予總統的職權對陳水扁行使特赦，再根據赦免法第3條對受罪、刑宣告之人，給予免除其刑的執行。也就是陳水扁一旦獲「免除其刑的執行」特赦，仍屬有罪之人，但未執行完的殘刑就不必再坐牢，若陳水扁堅持自己無罪，就要向憲法法庭聲請裁判審查，或請檢察總長向最高法院提起非常上訴。另外也可讓陳水扁的罪、刑全免，不過這將形成「貪汙無罪」的荒唐情況。

幕僚單位研議發現，特赦陳水扁最棘手的難題，在於有「海角7億」之稱的11億餘元不法所得該如何處理，目前因確定案件向法院聲請沒收約3億元已入國庫，尚在查扣中的有8億餘元，包含瑞士政府凍結的約1000萬美元，僅屬資金凍結，若陳水扁獲得特赦，還未聲請沒收的8億餘元恐將全數發還扁家，加上遭查扣的上億元豪宅、鑽石珠寶等也得解凍，恐坐實總統貪汙及洗錢犯罪可保有犯罪所得的批評，社會大眾恐怕難以接受。

幕僚單位認為，刑法的沒收新制應可化解此一難題。為避免衝擊過大，將針對扁家已扣案的11億餘元犯罪所得全部聲請沒收，至於二次金改等因病停審案件，被告除了陳水扁外，還包括前總統府副祕書長馬永成等，依法無法特赦，將留待司法後續審理，陳水扁妻子吳淑珍因健康因素無法入獄、兒子陳致中等家人涉洗錢及偽證等罪，也都遭判罪確定，除陳致中入獄後已假釋，其餘陳幸妤等家人均獲緩刑結案，都不適用此次特赦。

有黨政人士異想天開指稱，陳水扁獲特赦，政治面應能消除藍綠利用此議題造成的對立狀態，可以建立和諧的政治環境，帶給國內政治穩定及讓部分人心得到安撫，且台灣社會對扁案應否特赦爭執不斷，如果遲未處理，會讓政府持續陷於兩極對立的紛擾，更會因保外就醫踩紅線一再引起爭議，希望透過特赦免除後續紛擾。對此，鏡週刊報導指出，特赦阿扁仍是高度的政治性議題，一旦作出決定勢必會讓藍綠角力再起，社會紛擾是否會因特赦暫時畫下休止符或是激起濤天巨浪仍有待觀察。