台北市長蔣萬安今(11)日針對議員回覆寶林茶室專案報告提問時指出， 3月26日寶林傳出4起案件時食藥署並沒有立即查扣食材，更進一步表示市府命令寶林茶室暫停營業時曾接到來自中央關切電話。食藥署稍早回應，指出事發時不但主動攜回食材，並嚴正聲明從未關切過寶林茶室停業。

食藥署表示，台北市「寶林茶室」食品中毒事件緊急，因此判斷需快速介入協助台北市政府之必要，食藥署也主動於113年3月26日前往稽查，邀請毒物專家及疾管署防疫醫師隨行，也會同台北市政府衛生局一同行動，希望透過再次仔細查察，查出事件原因。

食藥署副署長林金富表示，食藥署絕無表示不願意協助處理檢體，協調後仍由食藥署攜回35件食材檢驗，並配合衛福部3月27日專家會議，食藥署與疾管署、台大法醫研究所、台大醫院、台北榮民總醫院各單位， 分工對食材、病人檢體及環境檢體辦理後續檢驗。

林金富強調，當時台北市政府命寶林餐廳停業，新北市政府查核粿條的供應商並令其暫時停止營業，中央地方共同合作查找原因並預防事態擴大，衛生單位同仁查核至深夜，食藥署從來沒有未就台北市政府衛生局對寶林茶室停業一事，做任何相關批評。