對於中國船艇越界在金門海域翻覆事件，中方今(5日)稱等不到台灣道歉，憤而離開金門，行政院長陳建仁在立法院備詢時表示，等到檢察官偵查知道真相在哪裡後，「有了真相後，我剛才也說過，該道歉就道歉，該賠償就賠償」。
民進黨立委李昆澤下午質詢時表示，中國代表及家屬在剛剛已經離開台灣，代表團團長指責台灣撞擊大陸漁船這是惡性事件，說台灣否認事實、謊話連篇，設置各種障礙推卸責任，說台灣沒有協商誠意，後果要民進黨負責。
對此，海委會主委管碧玲說，剛剛聽到對這件事情的定位雙方的落差是非常大的。第一、台灣是民主法治國家，所以事件發生開始的協商，我方都堅持把事實交給客觀獨立中立的司法機關調查後才可以釐清責任，只要責任一釐清就勿枉勿縱；第二、在司法調查釐清真相前，我方願意優先撫慰家屬，對家屬表達誠摯關懷，提供實質的協助。這部分可以達到某種共識，只是名稱仍然有堅持。
管碧玲說，第三、發生此事，非常遺憾，也知道家人痛苦，所以安排海巡署許副署長藉由記者會公開道歉，對於沒有錄影帶即時迅速讓社會瞭解真相，對社會表達公開道歉，並由署長上香時對亡者死亡表達歉意、撫慰家屬、致贈慰問金。甚至對於未來要如何道歉，都有提出版本溝通。但最後這版本還沒達成共識；第四、對家屬關心的遺體、船隻發回表達了最大誠意，在司法制度與家屬之間已經努力溝通，願意在司法體系完成必要程序後，將將依家屬意願協助。她期待未來雙方還是能化解歧見，讓問題得到妥適的安排。
陳建仁也說，對於海巡署同仁從事查緝、驅離動作，是依法辦理。但是對發生不幸溺斃事件，「我們是感到相當的遺憾」。也希望如管碧玲主委講的，希望給予最好的撫慰，但台灣是個自由民主法治國家，事件發生後的證據依檢察官真查辦理後才能知道真相在哪裡。「有了真相後，我剛才也說過，該道歉就道歉，該賠償就賠償」。
