針對立法院長選舉，有媒體放話指民眾黨主席柯文哲曾致電民進黨，盼綠支持黨團副總召黃珊珊當立法院長，換取白營挺綠委蔡其昌當副院長，但因民眾黨信譽不良，民進黨無法接受提議。不過，柯辦痛斥民進黨是非黑白顛倒，明明是綠營來遊說，但柯認為「新潮流投不下去（指蔡其昌）」。對此，柯今（2日）還原該事件，並直言民進黨四分五裂，總統當選人賴清德也管不了立院，立院自己幹自己的，奉勸民進黨內部快整合，不然對國家運作不利。

柯文哲上午於民眾黨團召開完黨團會議後，接受媒體聯訪，柯透露，在1月13日投票結果出來後，民進黨也知道居於劣勢，半個多月也從來沒人來找我們協商或來拜託我們，每天只看到「老柯」（指民進黨團總召柯建銘）在罵我們，「我內心就覺得很奇怪，你是要拜託我們的選票，啊每天在罵我們，這怎麼一回事？」

柯文哲表示，到投票前一天下午，終於民進黨各路人馬都開始來找我們，甚至有人說要我們回電，基於什麼醫界大老，所以當然他回電，但也說需要內部討論一下，所以在投票前一天晚上10點還緊急開線上會議，最後結論很清楚，「我還用寫的，意思是如果你們要支持黃珊珊，我們當然是歡迎，但我們不能說『交換』，副院長我們還是不投新潮流，故事就是這樣」。

現場媒體追問，醫界大老是誰？柯文哲直言，「我是現在還沒有想要抖出來，我也勸民進黨不要每天在那裡放話，大家好來好去，你要這樣每天鬼扯，就全部講出來」。

柯說，醫界大老是很多，他覺得如果民進黨要拜託民眾黨支持，那就早一點來講，從來也不出現，每天罵我們，前一天跑出來。柯文哲也提到，從這件事就發現，目前民進黨四分五裂，賴清德也管不了立法院，立法院也是自己幹自己的，「明講嘛！我看柯建銘也沒支持游錫堃當啊，所以啊你們到底誰代表誰？」不過這樣，吵吵鬧鬧也是政治上常態，不過，「奉勸民進黨內部快整合，不然對國家運作是不利的」。