首場藍白合作的幕僚會議於14日結束，雙方在候選人產生方式及部分細節上未能達成共識。不只藍白合有歧見，柯侯政見也存在分歧，柯文哲今(15)日在回應民眾提問時，明白反對國民黨總統候選人侯友宜所提出的成立「新特偵組」，柯文哲甚至公開點名「黨產會」，若是他當選，就會「清掉」。

柯文哲晚間參與了位於木柵忠順廟舉辦的廟口開講活動，現場有民眾提問，若柯當選總統，是否會清除目前的數位發展部、打詐辦公室、少子化辦公室等單位，或者擬建立額外的特偵組等。柯文哲立即直言「我個人是反對特偵組」。

柯文哲進一步解釋，法律應該要一致，他不認為辦部長跟辦老百姓要有不同檢察官，「難道檢察官只敢辦老百姓，不敢辦部長？」若需要成立特偵組，這代表我們是個落後國家，不是法治國家，應當建立法律一致性。

柯文哲表示反對「遇到什麼事情，就搞什麼單位」的做法，例如不當黨產處理委員會、促進轉型正義委員會，柯直言「你們放心好了，上台全部把它清掉」。柯文哲說，「給你16年的時間，你還不知道真相，我不要聽了。」

柯文哲批評民進黨長期以來不斷強調轉型正義，並不斷提及二二八事件，暗示其未能揭示真相。他認為民進黨利用歷史仇恨作為政治資本，並指出過去歷史事件應盡速解決，而不是每年拿出來炒、製造仇恨，還要說國民黨的黑金回來了。