海葵颱風已於今(5)日減弱為熱帶性低氣壓，不過中央氣象局表示，金門、澎湖及西南沿海有長浪發生的機率。因此，交通部表示，今離島、兩岸船班共有13航線、104航次停航。國內線航班則仍有27架次取消。

根據中央氣象局表示，外圍環流影響，台東地區及恆春半島有局部大雨發生的機率，且金門、澎湖及西南沿海有長浪發生。因此，民航局表示，受海葵颱風影響，國內線取消27架次，國際暨兩岸航線未受影響。

至於船班，航港局表示，包括基隆－馬祖、馬祖福澳－福州琅岐、北竿白沙－福州黃岐、南竿－莒光、金門－石井、南竿－東引、金門－五通、布袋－馬公、台南將軍－澎湖東吉、東港－小琉球、鹽埔－小琉球、富岡－綠島、後壁湖－蘭嶼，部分停航，總共104航次停航。