台鐵於4月26日起有386班次大改點，自強號運能將提升8.7％。而近日台鐵局因配合新車投入營運，6月28日起再度調整時刻表，此次調整共74列次受影響。

台鐵局此次調整配合新車投入營運，以EMU3000型及900型替駛班次，原普悠瑪號222次(樹林-瑞穗)、229次(瑞穗-樹林)及太魯閣號團體列車21次(台東-樹林)、22次(樹林-台東)則改由EMU3000型自強號替駛。另4030、4033、4019、4032、4035、1140、4028、4037、4050、4003次等10列次區間(快)車，也改由EMU900型電聯車替駛。

而台鐵此次也增加停車站班次，EMU3000型自強號411次(台東-樹林)、438次(樹林-台東)增停富里站。EMU3000型自強號371次(台中-台東)、386次(台東-台中)增停新烏日站。2007次(基隆-二水)、2042次(二水-七堵)區間快車增停社頭站。

至於延長行駛部分，4042次(宜蘭-花蓮)區間快車改由七堵站始發。4191次(蘇澳-鶯歌)、4240次(鶯歌-南澳)區間車延長行駛至桃園。4519次(台東-關山)、4512次(關山-台東)區間車延長行駛至池上。