11月26日九合一大選民進黨慘敗，衛福部部長薛瑞元「疫苗掮客」說，被視為是壓倒民進黨台北市市長候選人陳時中的最後一根稻草。薛瑞元今他出席「健保醫療資訊雲端查詢系統標竿學習分享會」再度被詢問是否要為此辭職？他表示，他個人去留並不重要，且內閣改組應不是閣員做決定。
薛瑞元因選前一週發表「疫苗掮客」說，並認為陳時中在買疫苗時期擋了不少人財路因此得罪了不少人，此一番言論被外界認為讓陳時中選情失利，薛瑞元近來出席各項活動時皆會被媒體問及是否要為此負起政治責任辭職下台。他曾表示，政治責任他不會迴避。今日他直言施政不應因一次選舉失利而延滯，而黨內目正檢討中，內閣要改組等相關需做通盤考量，也非閣員能決定，而團隊的決定，但他再次強調「我個人是去留不重要。」
