今有媒體報導指出，因中選會規定確診者不能外出投票，造成各地方選委會如何處理和安排方法都不相同。中選會今針對此發出新聞稿表示，全國各地選務做法仍屬一致， 11月26日投票時民眾均應依傳染病防治法及公職選罷法等規定辦理，而若有違反傳染病防治法規定者，還是會交由衛生主管機關依法處理。
今有媒體報導，因傳染病防治法規定，確診者目前無法出門投票，因此目前全國各縣市做法不一，如彰化、桃園，均將提供確診隔離者名單至各投票所，避免確診者領票、投票；台中與其他部份縣市則認為因個資涉及隱私考量，不提供確診者名單，但若被檢舉查證屬實即不可投票，而若投票後被檢舉則選票照常計算，但要開罰。
中選會對此表示，各直轄市、縣市選委會仍呼籲國人遵守傳染病防治法與公職選罷法等相關規定，並應配合選務遵守投開票所之防疫措施，以保護自己及他人的健康權利；至報載所稱是否仍有特定市縣採取不同做法一節，中選會也會再予瞭解並請其與全國各地選務做法一致，且定會做好防疫清消等工作。
中選會說明，依該會所提選務防疫計畫，目前並無掌握確診名單之規劃，或是地方選委會得向當地衛生局取得相關人員資訊等規定。而中央流行疫情指揮中心也是請國人遵守居家照護的規定，如確診者在未解隔離前仍應遵守傳染病防治法與相關防疫措施之規定。
中選會也進一步表示，該會及各地選委會對於投票所場地消毒、動線規劃佈置、選舉人或投票人，以及選務人員安全防護等均採取高規格選務防疫措施，請民眾安心投票。配合選務之防疫措施，則如請國人仍佩戴口罩始進入投票所投票、保持社交距離、進入投票所前應量測體溫並進行手部消毒，且圈選工具及圈票處等都會定時及適時予以清毒，選務機關定會做好選務防疫措施。
