中華民國防疫學會理事長王任賢表示，批評指揮中心為了消化2000萬劑莫德納疫苗，因此不採購BNT雙價疫苗，讓12歲以上青少年、5~6歲打莫德納過敏民眾恐成疫苗孤兒。指揮中心發言人莊人祥則說明，此部份因為BNT公司未送件5～11歲的次世代疫苗，莫德納疫苗則早就把6～11歲疫苗的所EUA相關文件送到食藥署，他表示是送件進度，「不是我們對BNT大小眼」。

中華民國防疫學會理事長王任賢表示，中央與莫德納簽約2000萬劑次世代疫苗，但莫德納次世代疫苗適用對象是6歲以上，BNT次世代疫苗則是5歲以上，目前中央僅核準通過莫德納疫苗於6～11歲使用，不採購BNT雙價疫苗，卻讓目前5至6歲兒童沒有BNT次世代疫苗可以接種，他批評「這真的很糟糕」。

莊人祥表示，中央核準通過莫德納疫苗於6～11歲使用，是因為莫德納早就已經將EUA相關文件送給食藥署，雖然BNT BA.5次世代疫苗即將在歐盟申請EUA，且適用於5~11歲兒童，可是台灣尚未收到該公司EUA申請文件，他強調並非是台灣對BNT大小眼，是送件進度的問題。