台大認定民進黨桃園市長參選人林智堅論文抄襲情節嚴重並撤銷他的碩士學位，衝擊年底選情。兼任民進黨主席的蔡英文總統10日在中常會上向黨內喊話，要求全黨「支持智堅捍衛自己的清白」，引發在野陣營猛烈砲火。對此，民眾黨主席、台北市長柯文哲表示：「『誠信』是做人做事的基本要求，身為台大校友、台大老師，我支持台大堅持學術倫理，捍衛百年聲譽。」
柯文哲10日晚間在臉書Po文強調：「我認為，從事公共服務的人，有沒有碩博士論文不重要，但『正直誠信』很重要。販賣學歷、 論文抄襲、升等聘書封存不敢對外公開，這些都是歪風。更不該為了一時的選舉，連台大都抹黑，還發動網軍、側翼進行攻擊。」
柯文哲指出，整件事情，老師要負最大責任，怎麼會把同樣資料交給兩個學生去寫，兩個學生的論文高度雷同「怎麼還能發出畢業證書？一個老師指導173個碩博士生，為什麼只有5個論文公開？難道其他的全部涉及國家機密，不宜公開？這些問題不是今天才出現，早就有傳聞」。
柯文哲續指，林智堅論文案不會是個案，台大的錯誤自己要檢討、反省、承擔，但民進黨的態度讓人更痛心，他直言：「當初民進黨的理念『清廉』、『勤政』、『愛鄉土』如今安在？這個黨已經不是我當年認識的民進黨，為了一時的選舉，連台大都要攻擊毀滅。不要為了政黨利益，犧牲國家長期利益。政黨不能只有選舉輸贏，而沒有道德底線。」
