外界盛傳疫情指揮中心指揮官陳時中將投入年底台北市長選戰，陳時中日前回應，「沒有在用選舉」，卻遭台北市長柯文哲酸「不談選舉容易、不想才困難」，且提到可能會因為選舉考量，政策上會有些偏頗，對此，陳時中今(17)天在疫情記者會上表示，「不至於管到這麼厲害吧，這又不是以前在當作思想犯在管」。

陳時中回應，政策上，以政務官而言，思考的是怎麼做對社會好，就他身為防疫指揮官而言，就是要把疫情控制住，能把減災做好，不管是藥物準備、疫苗的施打及輕重症分流等。

而針對柯文哲說「不談容易、不想才困難」的說法，陳時中則笑說，也不至於管到這麼厲害，又不是以前那個時候當作思想犯在管。