近兩年因COVID-19疫情，許多行業都受到衝擊，台灣高鐵的營收和獲利也大幅衰退，不過隨著疫情趨緩、旅客漸漸回流，台灣高鐵公司25日晚間宣布，10職等以下員工整體約加薪2.5%，4月1日起生效。

高鐵公司表示，審視外部經濟情勢、內部營運狀況與市場薪酬競爭力等因素整體評估，經董事會同意，辦理今年的「年度績效調薪」，照個人績效評等、薪資落點等標準調薪，以展現對員工的鼓勵與照顧，整體調幅約為2.5%，並在4月1日生效。

不過，高鐵公司也說，在營收減少、預算有限情況下，這次調薪無法包含11職等以上的主管與員工，仍對所有人員的努力與貢獻，致上十二萬分的肯定與感謝。

2021年5月中旬台灣發生嚴重的本土疫情，國內疫情警戒升為三級，大眾運輸運量也大受影響，高鐵6月營收一度銳減至4.01億元，後續隨著疫情控制回穩，每月營收回升，加上高鐵平穩基金支撐，因此去年稅前盈餘仍有42.65億，僅較2020年衰退約21%。