行政院在中選會發送的公投公報上表示，「反萊豬公投通過與否，均不影響農委會2020年9月7日公告效力。」引發國民黨立院黨團批評，這是白紙黑字說明不尊重公投的結果。對此，行政院長蘇貞昌今（14）天受訪駁斥，「這是惡意的曲解」！

蘇貞昌上午出席第二屆國家農業科學獎頒獎典禮前受訪，做了以上表示。

蘇貞昌說，公投的結果，讓政府機關及全體國人都同樣受拘束，在公投法中有明白的規定，這也就是為什麼要把政府列為反方的原因，公投法要求政府機關要出來好好說明政府制定政策或政府所做的事，因為如果政策被公投結果推翻掉，整個都要受到拘束等，也就是避免政策發生變化。