為防堵非洲豬瘟病毒透過未蒸煮完全的廚餘進入養豬場，加上小型養豬場風險較高，農委會10月起禁止199頭以下的小型養豬場使用廚餘，苗栗縣農業處長李乙廷昨直指該政策是配合萊豬進口而設。對此，農委會主委陳吉仲今(18)日表示，李乙廷可能剛就任不久，因此將非洲豬瘟的防疫措施和萊豬配套弄混，希望他不要誤導農民。

李乙廷昨日在苗栗縣議會指稱，農委會禁止廚餘餵豬，是因為今年元旦起進口萊豬的緣故。對此，陳吉仲今日赴立法院經濟委員會前接受媒體訪問表示，現在非洲豬瘟最大的風險就是透過未蒸煮的廚餘傳播，過去案例發現，規模小場的養豬場都沒有依照規定蒸煮，為確保700億養豬產業及2000億元上中下游，從10月開開始要求199頭以下小場畜牧場不得使用廚餘。

此外，陳吉仲也說，今年元旦起雖開放萊豬進口，但事實上沒有任何一塊有萊劑的豬肉進來台灣，且有清楚標示肉品產地等，反而讓國產豬自給率提高至9成3，台灣豬肉交易價才能維持20年來的高價，台灣的種豬也能外銷到越南、菲律賓。李處長剛上任不久，完全誤解非洲豬瘟防疫，說法也與事實不符合，呼籲地方政府剛上任的農政機關對事情應該要全面了解，不要誤導農民。

而對於行政院副院長沈榮津日前出席F16維修中心廠商聯誼會時，被舉發公開宣傳「4個不同意」，遭質疑在公務時間，利用出席活動機會宣傳公投，挨轟行政不中立。對此，陳吉仲則說，政務官本來就是「兼顧」，要將4個公投論述說清楚，他也舉例，自已被問到非洲豬瘟防疫、萊豬跟國內產業影響，都是有必要跟全國消費者、農民說明白。