近來 COVID-19 疫情在中國仍持續延燒，繼先前莆田升溫後，最新單日報告廈門病例數新增 39 例，反超莆田 4 例。對此，廈門昨 (19) 日晚間突通知，取消自 20 日起自廈門出港的中國國內航班，廈門到外地的火車票也已無票可賣。不過，卻有報導指出，廈航方面反駁，後續每天還會有國內出港航班。
據陸媒《第一財經報導》，大陸航空公司是在傍晚廈門市召開新聞發布會，通報 9 月18 日 0—24 時，廈門市報告新增本土確診病例 39 例，截至 9 月 18 日 24 時，廈門市累計報告確診病例 131 例等訊息後，接獲廈門機場運行協調管理委員會通知。
因此自 9 月 20 日起，航空公司取消自廈門出發的大陸境內航班，恢復時間視廈門市疫情防控情況另行通知。與此同時，多家航空公司多條廈門出港航線的航班動態，20 日的航班均已取消。且 20 日起廈門至外地的火車票也已顯示無餘票，但由外地至廈門的火車票仍可購買。
不過，陸媒《央視客戶端報》卻指出，在 9 月 20 日當天，廈門高崎機場仍有國內的出港航班，分別是廈航的 MF8567 （廈門-上海虹橋）和 MF8491 （廈門-重慶）航班。廈航方面也證實，這兩趟航班將正常執行，後續每天還會有國內出港航班。這也打破了廈門市「取消所有出港航班」的網絡傳言。
據了解，「鞋都」莆田市從 10 至16日的通報數據已在 6 天累計確診 261 例，其中兒童人數多達 57 人，其中年齡最小為 3 歲。因此進入「半封城」狀態。其中兩條感染傳播鏈，分別在當地的一所小學和鞋廠，由於短時間內就迅速向外擴散，臨近的廈門、泉州目前都有確診病例。而目前，廈門累計確診病例已到 131 例。
經專家組研判分析，本次疫情起源是外市輸入病例，在工廠等人群密集場所暴發和擴散，在首次報告病例前已經傳播 2 至 3 代，導致疫情形勢嚴峻複雜，對陽性樣本進行基因測序後，檢出 28 份樣本均為 Delta 變異株，且高度同源，屬於同一傳播鏈。
