長榮航空3名機師出現突破性感染，而指揮中心取消機組員的抗體追蹤遭外界質疑。對此，專家諮詢小組召集人張上淳表示，數千名機組員打完疫苗，只有極少數人不會產生免疫反應，而且專家小組認為定期追蹤抗體並沒有實質意義，目前在評估追加第三劑疫苗的做法。

張上淳說明，專家小組一開始建議指揮中心定期針對機組員做抗體追蹤，但是第一次的篩檢發現，幾千名機組員當中只有7位不會產生抗體，比例非常低，至於對會產生抗體的人，持續追蹤抗體也沒有實質意義，因為抗體力價會隨著時間逐漸下降。

張上淳表示，考量到病毒變異株肆虐，加上機組員經常需要飛到其他國家，專家諮詢和ACIP委員會確實在考慮追加第三劑疫苗的可能性，現在的重點是在何時需要追加，而不是每三個月定期追蹤抗體，這麼做的意義不大。

有關追加第三劑疫苗的安排，張上淳表示，目前還是希望能夠得到更多相關資訊，日後會根據疫情狀況，還有疫苗配送情形和指揮中心配合，現在暫時沒有定論。

針對7名未產生抗體的機組員，張上淳表示，會另外單獨處理，先查清楚原先施打的疫苗廠牌，若要接種第三劑，也需要經過本人同意。由於這個部分超過指揮中心原設定的範圍，ACIP委員建議以研究方式處理，才不會和疫苗注射規定抵觸。