立法院臨時會今天(18日)三讀通過紓困4.0特別預算追加案，將原歲出規模2600億預算，刪減5億餘元，改列2594億9900萬元，用於紓困、補貼、疫苗採購等。其中預算規模最多的為衛福部，共編列792億元，以辦理疫苗、藥品臨床試驗、採購及檢驗等。
有鑑於本土疫情爆發，衝擊各行各業及勞工，行政院會6月3日通過「中央政府嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別預算第3次追加預算案（109年1月15日至111年6月30日）」，總規模為新台幣2600億元，全數以舉借債務支應，送請立法院審議。立法院於6月7日至18日召開臨時會，處理紓困4.0特別預算案，並力拼在今天完成三讀。
立法院昨天上午9時30分進行朝野協商，研商紓困4.0特別預算案相關事宜，歷經約13小時馬拉松協商，將朝野立委所提542案處理完畢、保留72案，同時達成刪減預算共識，包含國家通訊傳播委員會（NCC）編列簡訊實聯制預算新台幣8億元，減列5億元預算，另考量政府經費短絀，精簡經費從經濟部編列紓困振興業務費中刪減100萬元預算；朝野黨團今天上午繼續第二輪協商，最後保留27案，經表決後，全案於下午完成三讀。
就此次預算中，預算規模最高的為衛福部，共編列792億元，用於辦理疫苗與藥品臨床試驗、採購及檢驗，發給防疫具績效者獎勵金等；次高為編列584億元的經濟部，預算將用在辦理商業服務業的員工薪資及營運成本、會展產業的員工薪資補貼，以及事業貸款融資保證、利息補貼及融資診斷等。
預算第三高為勞動部，共編列449億元，用於辦理自營作業者及無一定雇主的勞工生活補貼、勞工紓困貸款利息補貼等。
此外，院會也通過多項提案，包含國民黨立委費鴻泰等人所提，要求行政院就「3 11」決策釐清過程，3個月內成立調查小組，提出書面調查報告予立法院，並對於確診往生家屬提出相關慰助金機制；國民黨立委林奕華所提，要求衛福部研擬提供因本土新冠肺炎死亡的國人，每人新台幣10萬元的喪葬費補貼等。
不過，國民黨團要求普發1萬元現金、民進黨社群中心主任范綱皓涉及疫苗言論被認定非事實，藍委要求衛福部應調查並開罰、藍委要求行政院立即成立「新冠肺炎傷亡國賠專責小組」等，經過表決後都被否決。
