國內疫情持續擴散，許多政府單位及民間企業都宣布實施在家上班，台灣高鐵公司表示，因為疫情載客量大減，經審慎評估疫情變化及旅客需求後，決議自5月21日至6月10日實施短期班表，每週減少171班列車，但仍維持超過8成之運能，以滿足旅客基本需求。
高鐵表示，目前每周班次為1016班，考量到疫情發展，旅客需求也改變，因此自5月21日起實施短期班表，每周班次調減至845班，仍維持超過8成之運能，各車站全時段每小時至少維持南下、北上各1至3班次旅運服務。
由於班次調整，部分列車遭取消，高鐵表示，將針對購買遭取消車次之車票且有留下聯絡方式之旅客，主動透過電子郵件或簡訊發布通知，並依旅客需求協助辦理退票或改訂其他車次。若旅客未及於乘車前改訂其他車次，站務人員將於現場協助退換票或改搭當日最近車次繼續行程。
高鐵也提醒旅客，即日起至6月8日止，高鐵各車次實施全車對號座，付費候車區及車廂內均禁止飲食，旅客若因生理需求（如喝水、服藥、哺乳）需飲食者，請遵守保持社交距離規範，並應於飲／食用完畢後，儘速佩戴口罩，高鐵也將密切觀察疫情變化並配合政府最新防疫政策進行滾動式檢討，將於6月初公告6月9日以後（含端午疏運期間）相關營運服務規劃。
另外，高鐵指出。各縣市實施三級警戒期間，凡旅客購票後已領取實體車票（含便利商店紙票）者，乘車日於三級警戒期間內，不限搭乘區間，因故不及於期限內辦理退票，均可自票面乘車日起一年內，持實體車票至高鐵各車站窗口辦理退票，免收手續費；此外，旅客購買去回程車票，其中單程乘車日期如非三級警戒期間內，仍可同時攜帶去、回程車票，至車站窗口辦理退票，高鐵將一併免收去回程退票手續費。
