昨晚間衛福部發布消息表示，有相關媒體報導或網路流傳訊息，指「善款8.1億僅1／3給罹難者家屬」，引起外界關切，為避免捐款者擔心誤會善款之運用，衛福部特別澄清說明自善款使用對象、方向、項目等相關事項提出說明，並嚴正表示，該善款100%用在罹難者家屬、傷者及其家屬、救災人員身上。

衛福部在4月12日召開0402台鐵408次列車事故案捐款，管理及監督委員會第1次會議，後經各方委員討論及共識，善款使用項目及對象分述如下:

1）實際收受捐款金額確保至少1/3會用在罹難者家屬生活扶助。

2） 其餘經費使用項目及對象:

1.生活扶助：協助傷者和家屬之生活。

2.醫療補助：提供傷者於賠償及健保應付費用之外之醫療、復健費用。

3.教育資助：針對罹難者家屬、傷者、傷者家屬之相關教育費用。

4.心理重建：對於罹難者家屬、傷者、目睹乘客、救災人員相關之專業心理輔導及重建協助。

5.法律扶助費：協助罹難者家屬、傷者所需之經費。

6.辦理罹難者之家屬、傷者及其家庭之關懷支持或重建等服務(為期3年)。

衛福部表示，這次捐款秉專款專用及公開透明原則，決不會用善款來替政府或廠商賠償，善款100% 用在罹難者家屬、傷者及其家屬、救災人員身上，定期公告捐款運用情形，讓捐款人以及社會大眾掌握捐款的流向，共同監督善款的使用。