健保會於109年11月27日臨時委員會議審查費率時，對110年應調升費率之共識，惟獨調整幅度尚無法達成共識，最後提出二費率建議案，分別為甲案：4.97%、乙案：5.47%～5.52%。今衛福部表示，一般保險費費率先恢復至二代健保施行前之5.17%(補充保險費費率依法連動調整至2.11%)，未來視經濟復甦情形再適時檢討。該建議於109年12月31日經行政院核定，衛福部亦將立即發布施行。而預估受影響為農漁民與受雇者2大族群。
衛福部表示，最近一次調升費率是在99年4月1日，由4.55%調整為5.17%，此後則是2度調降。首先是配合102年二代健保施行，在擴大費基新增補充保險費及強化政府負擔等財源下，調降為4.91%；嗣因健保會於104年11月20日第10次委員會議審議105年度費率時，研訂實務面用以審議費率之「全民健保財務平衡及收支連動機制」，並據以建議調降105年度費率至4.69%(補充保險費費率連動調降為1.91%)，經衛福部轉報行政院核定後實施迄今。健保財務也因此自106年度起開始入不敷出，且短絀數逐年擴大，健保署估計，若維持現行費率，110年之安全準備將不足一個月保險給付支出之最低法定標準。
調整後原本接受政府全額補助約126萬民眾(如低收入戶、替代役…等)，其保險費負擔皆不受影響；至於受僱者平均每人增加63元，7成以上每月增加70元以內；以月薪24,000元、30,000元、70,000元及180,000元為例，每人每月分別增加34元、44元、105元及262元。
至於投保單位之相關準備時程，健保署表示目前健保費之開單作業，係於次月20日開單及月底前繳納，並有15日之寬限期，亦即1月份保險費在3月15日繳納即可。
全民健保是各界關心的重要施政，在逐漸浮現的財務壓力下，對制度精進與改革期待也更加殷切。衛福部除致力解決財務問題外，對各界關心議題，也會在公平合理原則下，一併提出改革措施，包括整合醫療資療有效運用、抑制資源不當耗用，減少浪費等各項措施、檢討旅外國人權利義務、持續推動就醫部分負擔、擴大補充保險費計費基礎等，並已規劃4至6年「全民健康保險中長期改革計畫」，改革健保給付及支付制度與健康照護體系，整合公共衛生體系與健保資源，以提升健保給付價值、醫療服務效率及品質。
