12月1號零時起將實施的秋冬防疫專案，規劃就算是台灣人入境前也需附3日內核酸檢測陰性證明，引發各界討論，更有台商指出此規定違反健保原則。今疫情記者會上莊人祥表示，12月1號秋冬專案實施後就是一定要有陰性證明，國人若在外地染疫可於當地就醫，花費費用回國可申請健保，。

國外目前爆發的第二波疫情已經比3月時第一波嚴重好幾倍，為此指揮中心將於12月1號時起將實施新秋冬防疫專案，其中出入境的將嚴格規定只要入境，無論是誰都需要檢附3日內核酸檢測陰性證明。然目前已有部份國家，12月左右或前已可開始施打武肺疫苗，是否施打過的人還要該證明才能入境？或打過的人還需要隔離嗎？

對此莊人祥表示，目前除中國在還沒完成臨床實驗前就實施大規模的接種，全世界沒有任一個國家有接種過疫苗的經驗，也不知道各廠牌疫苗施打後的保護力如何？保護力可維持多久也不知道，因此沒有一個國家有針對這部份有任何規劃，在台灣當然也很難評估。

而是否12月1號在外染病的國人就無法回台？更有台商指出此一規定已違反健保原則，莊人祥針對此點指出，若在當地感染，也可在當地就醫，花費費用回國可申報健保，至於該條是否違反健保原則，他認為該請教健保局。

至於無法提供3日內核酸檢測陰性證明，若非自身因素造成，如因當地醫療條件造成等等，這些都是可以再討論的，並非是要阻絕國人回國。但12 月1號一旦秋冬防疫新專案啟動，確實就是要有陰性證明，有國人憂國外陰性證明難取得，莊人祥則指出，如在美國，一般連鎖藥局都可做檢驗，他表示取得證明：「沒有很難」。