彰化縣衛生局日前採檢無症狀居家檢疫少年確診，意外揭露類似做法早已實施半年，採檢超過千人，中央流行疫情指揮中心出動政風調查，引發爭議。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中20晚間上節目親揭原因，他說：「防疫裡面會出最大的問題，就是大家不同調，政策混亂，那就會造成我們的疫情不明，結果我們的專業判斷沒有辦法做準，那然後就會產生很多的一些違失出來。」
對於藍營指彰化縣衛生局的案例都在系統中，中央等到彰化縣揪出確診者才動手打壓，陳時中在節目中解釋，通報系統裡當然有這些案例，但通報系統就是從醫院報出來的，會被認為就是需要去採檢的對象，他接著說明：「可是上面並沒有跟我們講說，這裡面採的是不符合我們採檢的要件。」並直言，彰化縣衛生局的作法明顯與規定不符，如果彰化縣要做篩檢不是不行，但是必須中央疫情指揮中心報告，報准才可以做。
對於是否認為被欺騙，陳時中回答：「我一向不喜歡說人家騙我，但他沒有告訴我是真的」，認為彰縣衛生局有行政違失。陳時中也指出，社區裡面本來就有無症狀者，但防疫的策略是評估會造成什麼樣的傷害，這樣的傷害能否控制住，無症狀者如果一直維持無症狀，他強調說：「以現在的科學的證據來講，這些無症狀的基本上，它傳染力非常的低。」
與陳時中一起上節目的前立委、醫師林靜儀則在臉書Po文表示，從首例武漢肺炎本土確診者起，每例確診或疑似個案都要進行非常龐大的疫調，民眾知道防疫的重要，所以願意誠實配合，提供了行蹤、接觸時間、症狀。結果彰化縣這一千多個「應該在隔離中的無症狀者」，不知道是使用哪些篩檢條件參與了檢查，可能造成了篩檢資料判讀分析的巨大錯誤。對此，林靜儀批評：「我不能理解，彰化縣衛生局明明是專業身份，你們不知道這可能有偽造病歷紀錄的問題嗎？這可能有公務資料造假的問題嗎？這可能干擾了嚴謹的防疫政策與決斷嗎？」
