武漢肺炎疫情持續擴大，陸委會先前放寬禁令讓陸配子女入境，未料引起民眾反彈，只好「髮夾彎」撤回，但前總統馬英九卻痛批政府此舉是「民粹碾壓人權，歧視凌駕人道」，對此，台北市議員徐巧芯表示，考量總統蔡英文是大量民意支持下等因素，馬英九「這樣的講話是太重了」。

徐巧芯14日晚間擔任政論節目《新聞面對面》來賓，對於馬英九的「民粹歧視說」，主持人謝震武詢問徐巧芯，馬英九這樣是不是言重了，而徐巧芯回應道，蔡政府是在過半的民意下執政，她認為馬英九「講話確實太重了」。

徐巧芯表示，她完全尊重民進黨政府現在的做法，「因為現在他們執政，所以所有成敗他們來負責」，但她同時也認為政府應該理解，為何其他人會覺得這些人的聲音也該被聽到。

此外，徐巧芯指出，1900多名陸配子女並非都掛病號，且當中有些人可能未來要成為中華民國國民，只是以我國現行法規限制下，陸配子女要申請成為中華民國國民是相對比較困難，也比較久的。