2016年有位女學生注射第二劑二價HPV疫苗後，第6天出現關節痛，診斷為發生幼年型特發性關節炎，並向衛福部申請救濟失敗，請求法院撤銷原處分，為國內首例循求司法途徑求償的「痛痛女」個案，台北高等行政法院後來撤銷訴願決定及原處分不利原告部分，判定「痛痛女孩」勝訴。衛福部今（14）日宣布，法院判決沒有引用到審議小組鑑定時所提的實證文獻及回顧說明，對此質疑並無相關辯證，因此衛福部決定再上訴。
女學生Bella（化名）於注射第二劑二價HPV疫苗後，發生幼年型特發性關節炎（Juvenile Idiopathic Arthritis），經衛生福利部預防接種受害救濟審議小組審定與HPV疫苗接種無關，惟考量其為釐清症狀與預防接種之關係，予醫療補助新台幣3萬元。
台北高等行政法院於4月11日宣判，訴願決定及原處分不利原告部分均撤銷；衛福部應依判決的法律見解作成准予給付一定額的行政處分；但原告其餘之訴也駁回。
衛福部需於判決書送達後20天內做出上訴與否決議，最後一天就是5月14日，衛福部預防接種受害救濟審議小組為此於5月2日召開專家會議，表示根據大規模實驗和數據研究都證實，HPV疫苗和自體免疫疾病、神經性疾病無相關性。
衛福部強調，法院判決未說明審議小組的審定理由是否構成恣意濫用或違法事由，也沒有引用到審議小組鑑定時所提實證文獻及回顧說明，不僅可能誤導民眾不敢接種疫苗，也恐影響未來案件鑑定審議的原則。
衛福部長陳時中表示，衛福部預防接種受害救濟審議小組即召開會議，一致認定疾病發生與疫苗無關，且法院判決對相關質疑並無任何辯證，因此昨天決定簽署上訴，一方面是希望法治社會中，當專業意見與一般意見有衝突時，交由法院做裁判，另一方面也希望疾管署能積極尋求家屬和解，撫慰家屬心情。
