季節限定美景「藍眼淚」又來啦！每年3月到9月這段期間， 是馬祖藍眼淚的觀賞期，其觀賞地點包含馬祖南竿、北竿、莒光及東引島以及各澳口均有可能看得到。
「藍眼淚」曾被CNN列為世界15大奇景之一，也有人稱作藍海現象，主要來自一種夜光蟲(渦鞭毛藻)，受到海浪及自然風的驚擾後而發出淡藍色的螢光，數量一多就會佈滿整個海上，形成一片藍色夢幻海的景象，近年來被發掘後，被許多人稱為「此生必看的美景」，也成為馬祖的觀光產業之一。
「藍眼淚」3月到9月都是觀賞期，但4至6月則是數量最多的時候，不過藍眼淚並不是隨時都會出現，想要欣賞藍眼淚必須把握兩點，第一，避免滿月前後前往，因為欣賞藍眼淚須在無光害的環境下，因此儘量避免農曆月圓前後，以免受月光影響；第二，需要有浪，由於夜光蟲是因為波浪的擾動，才會出現光芒形成藍眼淚，所以在開始滿潮之間前往是最佳時間。
而連江縣政府也整理出各區可以欣賞到藍眼淚的地點，包含南竿（大漢據點、鐵堡、53據點、55據點、20據點、26據點、12據點、翰林角、山隴海堤）；北竿（馬鼻灣、塘后沙灘、大沃山、螺蚌山、橋仔）；東莒（福正沙灘、燈塔青山嶼、大埔石刻、大埔村、神秘小海灣、猛澳碼頭；西莒（青帆港外堤、菜埔澳、坤坵沙灘）；東引（中柱港紅橋下、中柱島西北面、北澳、北海坑道、后澳、國之北疆、清水澳、西門流、老鼠沙）等。
另外，位於南竿的「馬祖藍眼淚生態館」，是第一座具有高互動性的自然遺產生態主題館，除了靜態的馬祖生態介紹外，更運用4D環繞虛擬實境，讓遊客身歷其境，不受季節天候的限制，一年四季無論白天或晚上，都能看見馬祖藍眼淚。
