總統蔡英文今(1)日發表元旦談話時表示，對岸若不能在疫情防治上合作，哪來「兩岸一家親」。台北市長柯文哲對此回應，這應該沒有矛盾之處，九二共識、兩岸一家親的口號在台灣被標籤化，沒事就拿出來講一講，其實最重要的是「彼此有善意」。他認為，如果大家心裡面都有芥蒂，再講什麼也沒有用。
蔡英文表示，在非洲豬瘟的防疫工作上，對岸政府一直沒有依照相關協議，將疫情誠實的、即時的通報給台灣，「一旦豬瘟傳進台灣，不僅重創相關產業，影響民生經濟，更重要的是，會造成台灣民眾對對岸的負面觀感。我們不樂見這種情況發生。」
柯文哲今日出席元旦健走活動時回應，疫情防治與兩岸一家親應該沒有甚麼矛盾。先前曾因發表「兩岸一家親、同文同種」而被網友砲轟的他，會不會認為蔡英文批評兩岸一家親是在針對他？柯文哲僅稱：「不會啦不會啦。」而被指他與蔡英文在升旗典禮交流冷淡，柯文哲撇清說，其實是按照流程在走，根本沒有機會互動。
台北跨年晚會藝人邰智源昨日(12/31)一直逼問柯文哲為何不想去總統府？柯文哲笑說，參加完跨年去升旗，升旗完再參加健走，這個錢實在太難賺了，他要不是當市長，在家裡看電視就可以了。記者追問這跟不想見蔡英文有關嗎？柯文哲回應，沒有關係，不要害他。
對於台北跨年晚會被民眾一致負評，柯文哲說，台北市政府跨年活動已經辦了20幾年了，不可能每年的節目都一樣，所以一定要創新改變，沒辦法提出10個活動，每個都100分，有時候難免會考1科不及格，市府還是會維持創新精神，需要改進的就再改進。
