在東奧正名公投衝擊下，中華台北奧會在國際奧會會籍可能不保。對此，外交部發言人李憲章今（27）日表示，外交部最重要職責在確保國人與各國運動選手能平起平坐，在各種國際賽事能維護國家權益與選手公平競賽前提下，爭取選手參與國際賽事。
1124地方大選與10個公投案一併舉行，其中第13案「東奧正名」主文：「你是否同意，以「台灣」（Taiwan）為全名申請參加所有國際運動賽事及2020年東京奧運？」不同意票5,774,556，超過同意票4,763,086百萬以上。
不過，中華奧會還是提出警訊，「中華台北」會籍目前停權或除權的危機仍尚未解除。
由於國際奧會執委會即將在日本舉辦會議，是否會有危及台灣會籍的議程提出，外界甚表關切。李憲章則說，外交部最重要職責在確保國人與各國運動選手能平起平坐，在各種國際賽事能維護國家權益與選手公平競賽前提下，爭取選手參與國際賽事。
公投第9案主文：「你是否同意政府維持禁止開放日本福島311核災相關地區，包括福島與周遭4縣市（茨城、櫪木、群馬、千葉）等地區農產品及食品進口？」同意票數7,791,856超過不同意票數2,231,425甚多，而且該案有效，對行政機關有拘束力。
對此，日本台灣交流協會台北事務所代表沼田幹夫25日表示，此次的公民投票結果，同意繼續對日本食品進口台灣的管制措施，對此結果他深感遺憾。他說，日方會繼續努力致力於讓台灣朋友理解日本食品的安全性。也殷切期盼早日解除每年都有許多台灣朋友到訪的福島縣、茨城縣、櫪木縣、群馬縣、千葉縣的食品進口管制措施。
李憲章則表示，對於核區食品議題，日本一向與台灣政府部門有相當聯繫。台日雙方對彼此立場也非清楚，這次公投結果，外交部會針對此事與日方進行相當溝通，並妥慎處理這個問題，尋求日方瞭解，畢竟這是國人透過公投進行公民意志展現，外交部立場還是希望在國際客觀標準、科學依據之上，以確保國人健康為最大前提。
李憲章說，台日關係相關議題很多，不希望單一議題影響台日關係的進展。
此外，台日經貿會議也將於28日在台北舉辦。
