對於歐盟官員來台稽核、卻適逢進行「福甡11號」是否違法調查作業。而歐盟從2015年對於台灣遠洋漁業舉黃牌至今已經3年，被問到是否會影響歐盟評估，漁業署長黃鴻燕今(28)日表示，個案應該不影響解除與否。
2015年受國際組織舉發台灣遠洋漁業涉嫌IUU（非法、未報告及不受規範）行為，歐盟在同年10月對此舉黃牌，至今未解；而歐洲經貿辦事處處長馬澤璉（Madeleine Majorenko）曾表示，的確相較過去，台灣需改善的清單項目已縮短很多，此次歐盟官員再度來台審視執法情況，來決定解除與否。
但是7月18日被國際勞工組織 (ILO) 質疑的高雄籍漁船「福甡11號」，疑似有「缺乏文件，住宿環境不佳，漁工食物不足，以及船上安全和衛生條件太差」等問題；另外9月間又有環境正義基金會（EJF）提供調查影片，質疑船長毆打船員、甚至要求工作長達22小時，船員因缺乏安全設施而受傷；此外涉嫌將多種多種瀕危鯊魚鰭身分離，把魚身丟回海裡，當中包括鎚頭鯊等。
黃鴻燕表示會對後來出現的證據進行調查，已勸導「福甡11號」於9月13日返台，9月21日進行卸魚調查，了解是否有上述等事實；然而目前還沒有完成，必須於調查完畢後才對外報告。另外由於歐盟官員訪台的成員中，有人受傷，尚在確認新的訪台時間。而歐盟黃牌解除端視整體執法的稽核情況，個案不大會影響解除與否。
