針對已經延燒多時的台大校長遴選案爭議，台大今（4）日發表聲明，對於教育部未能依大學法規定聘任新校長，表達遺憾與強烈異議，對此，將會遵行臨時校務會議決議，今天委請律師正式對教育部提出訴願，以釐清法律爭議。
台灣大學校長遴選委員會於1月5日選出台大教授管中閔為新任校長，原訂2月上任，後續管因諸多質疑引發爭議，一直未出任新校長，教育部5月4日發函給台大，針對在遴選程序中，有資訊未揭露等行政瑕疵，請台大一併注意，並且審慎處理，此外，也請台大重啟校長遴選程序。
對此，台大今發表聲明指出，學校已於5月12日召開臨時校務會議，決議要求教育部依照大學法等規定，處理校長遴選結果，並「盡速發聘」。5月22日依臨時校務會議決議回文，文中具體提出教育部應依法聘任管中閔為新任校長的法理依據，不過教育部仍於5月24日再度回文，要求重啟遴選程序。
台大在聲明中表示，繼續堅持大學自主的立場，遴委會已於1月31日的會議中決議管中閔當選資格並無疑義，臨時校務會議也明確表達教育部應依法盡速發聘。不過教育部未能依大學法規定聘任新校長，台大對此再度表達遺憾，以及強烈異議。同時，今日宣布遵行臨時校務會議的決議，委請律師正式提出訴願，期望釐清法律爭議，並且捍衛台大校長遴選的自主性。
針對此事，教育部代理部長姚立德表示尊重，並說不論是訴願或行政訴訟，希望雙方都能尊重結果。他說，訴願將由行政院的訴願委員會裁決，若仍有疑慮，之後還可走行政法院的圖竟。姚立德指出現在雙方互持立場，應由法院做定奪，他認為「這是最後一道防線」，並表示教育部會尊重結果，期待台大也是。
