新任教育部長吳茂昆上任以來，已經紛擾多時的教育爭議並未因此平息，反而因為自己的諸多爭議而成為風暴中心。全教總在今 (24) 日提出呼籲，盼吳茂昆在釐清所有爭議之前，能自行停止辦公，並請相關單位在最短時間能完成調查。 

全教總聲明稿中指出 : 當我們看到吳部長在國會殿堂上，侃侃而談的不是其教育施政理念，教育部同仁深夜加班撰寫的聲明也不是重大政策的說明，而是努力澄清新部長沒有涉及不法，全教總與多數第一線教師同樣感到沉痛，究竟台灣的教育何時才可以真正告別紛擾？吳部長又要把台灣的教育帶向何方？

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全教總表示，檢視吳茂昆歷來被投訴的案件，一時片刻恐怕難以釐清，在備受質疑的社會氛圍下施政，教育部的公信力也將大打折扣，為了教育長遠的發展，也為了部長的清譽，全教總呼籲行政院深思，在釐清相關爭議前，請吳部長暫時停止辦公，並請相關單位在最短時間內完成調查，讓教育早日回歸正軌。