近期麻疹疫情頻傳，有關外界指出中央政府無法掌握此次航空公司麻疹群聚個案接觸者（麻者潛在患者）通聯資料，導致地方衛生單位追蹤接觸者效率不彰，疾病管制署出面強調，本次麻疹群聚事件，均於個案確診後立即發布新聞稿，並提供個案航班資料讓市民注意。同時，疾管署利用「航空器傳染病接觸者航艙資料申請單」、「應用服務系統」、「戶役政系統」三樣利器來追蹤麻疹患者資料，確保衛生安全。
向航空公司提交「航空器傳染病接觸者航艙資料申請單」，資料包括旅客護照號碼、英文姓名、國籍，僅部分有留電話號碼；由於乘客未必是本國籍，故身分確認以護照號碼為主。或是至內政部移民署「應用服務系統」以護照號碼查詢，取得本國籍旅客身分證號。另外，內政部「戶役政系統」及疾管署「預防接種資料查詢系統」（NIIS），以身分證號查詢，也能取得旅客戶籍地址或部分聯絡資訊。
疾管署表示，由於旅客資料收集過程十分繁複，旅客資料不完整的原因，可能是旅客護照號碼在內政部入出境旅客資料庫中，查詢不到身分證資料，導致無法取得完整資料，或是內政部「戶役政系統」中有未登錄旅客實際居住地，且該系統資料欄位無電話項目。
另外，疾管署NIIS系統為2002年建置，對於年長者資料較不齊全，常有查無紀錄等情形發生，目前僅能將可得資料提供地方衛生局，由防疫人員循址親訪或再轉介其他縣市繼續追蹤。因麻疹疫情不容小覷，疾管署未來將透過中央部會間的協調，以尋求解決方案，減輕第一線防疫人員工作壓力並提升防疫效率。
