各方民間學者專家因4日花蓮發生芮氏規模5.8，僅間隔兩天，6日又發生芮氏規模6.0地震，造成此次0206地震是否為雙主震的說法引起熱議，而中央氣象局提出回應，地震測報中心監測課課長林祖慰則表示，此次花蓮地震並非是雙主震，但對於有無雙主震的說法，氣象局地震測報中心課長則表示，尊重各方學者專家的看法。
針對許多民間專家學者提出此次花蓮大地震造成此次災情，是因為有雙主震說法，林祖慰語帶保守表示，國際間認定雙主震的標準，是在較接近的時間，加上震央地點也較接近的情況，但其實目前無一個公定的規範，認定何種狀況就是一定認定為雙主震。而這次情況4日花蓮發生芮氏規模5.8地震， 6日又發生規模 6.0地震，氣象局較不傾向以雙主震認定，僅表示是活躍的地震活動劇烈造成此次地震，而依據最大一次芮氏規模6.0認定為主震，沒有將規模5.8的地震聯想為雙主震的發生，但氣象局尊重各方學者對於雙主震的看法。
此外，林祖慰也提到，過去台灣地震史上認定雙主震的案例，分別是在2005年宜蘭凌晨三點發生雙主震情況，此次兩個主震時間差僅70秒，首發地震芮氏規模5.9、再者又芮氏規模6.0，加上震央地點發生距離又相近；另外一個案例，是2006年在屏東外海傍晚八點，分別發生芮氏規模7.0的地震，同樣地震時間間隔僅10分鐘，在上述這些發生要素下，發生地震時間接近，加上芮氏規模大小差不多，震央發生地點也較相近下，同時較難判定哪次為主震，才會認定為雙主震的發生。
而關於判定主震的標準，林祖慰也表示，等到地震活動完整結束後，依發生芮氏規模數據去判定最大一次規模的地震，認定為主震，而台灣對於此次花蓮間隔兩天分別發生芮氏規模5.8、6.0的地震，僅認定為是活躍的地震活動劇烈造成。
