外傳總統蔡英文對公教、政務人員年改法法案三讀通過的結果不滿，猶如被立院黨團打一巴掌；主導年改的政務委員、年改會副召集人林萬億今（4）日接受Hit Fm聯播網《蔻蔻早餐》專訪時澄清，蔡英文僅說「不要和年改會版本相差太遠」，並未對其結果震怒，反而滿意改革成功，後續將與各部會協商，研擬施行細則。
6月27日率先三讀《公務人員退休資遣撫卹法》，18％優存2年後歸零，所得替代率首年將從現行約本俸兩倍的90%，砍至本俸兩倍的75%，再依每年遞減1.5%的幅度，10年後降至60%；現職人員退休金採計基準則延長為15年的平均俸額，退休金起支年齡延至65歲，並設有3萬2160元的樓地板數額。
年改三法在立院三讀通過的結果，其中，18%優惠存款2年歸零，以及所得替代率10年調降，與年改會的決議不同。外界質疑召開一年多的年改會挫敗，儼然「玩假的」。而且外傳府方不滿立院黨團與年改會不同調，身兼立院司法法制委員會召集委員的立委段宜康更在臉書開砲，立院審理法案居然遭到干涉，府方企圖施壓立院黨團。
對此，林萬億說，雖然年改會的年改法案版本和最終通過的版本不盡相同，但更能反映民意，而蔡英文僅說「不要和年改會版本相差太遠」，並沒有外傳不滿其結果，而且年改會召開以來，讓人民更了解年金制度與法令，有其效益，他也全程參與審理法案的過程，告知立委數字變化與法律之間的影響。
至於下一波年改輪到勞工與軍人，林萬億說，勞保、軍保都要等到立院下個會期才能討論，由於勞保2007年已經調整，設計一套較完整的提撥制度，修改幅度應該不大；而軍保由國防部及退輔會提出，處理現役及退役軍人的退伍金，他強調，軍保不會回到恩給制，也不會改為提撥制，並與公教人員一樣，設有樓地板數額3萬2160元。
林萬億說，推動年改就是要拿掉讓社會分裂的引信，以後就比較不會討論哪種職業的退休者「誰領得多」、「國家養的米蟲」等污名。
